对新军重新编伍，大家整体的争论不大，原则上原来五个团，就地升格扩编；新的机动旅旅长，袁翔甫、阿尔贝.皮埃尔都倾向于蓝新宇蓝仁鸿。
年后，陆军指挥学院正式启动，由袁翔甫兼任校长，克洛德.夏尔少校任常务副校长，主持学院日常教学事务。教导营的编制，将会保留下来，作为学院的临战编制；将来学员规模扩大了，也许会编成教导团。
海军指挥学院，年后也会启动；凌幼樵兼任校长，伍德.肯森上尉任常务副校长，嗯，整编后，伍德.肯森上尉军衔肯定会上升一级的。
水上纵队陆战营，也准备升格为三营制陆战团；也是就地升格扩编，团长自然还是钱芝化钱艾芜。
因为克洛德.夏尔少校调任陆军指挥学院，不再兼任师部副参谋长；副参谋长由赵宇民赵安骧接任。
既然这样，军事医学院更应该正式挂牌了；征询了大家意见，都同意让方子詹兼任院长，李家沧做常务副院长。
由于我大清的品级体系与国际现代军衔体系，有很多不匹配的地方；经内部讨论后，巡防师将官体系与大清品级体系，不再紧密挂钩，略有不同；作如下设置：
1、准将，军衔为一颗金星，正五品~从三品；
2、少将，军衔为两颗金星，从三品~从二品；
3、中将，军衔为三颗金星，正二品（类似总兵）；
4、上将，军衔为四颗金星，从一品（类似提督）。
经过几次讨论后，与十月底，完成了部队重新编组；十一月上旬，杨孟晗签署命令，宣布如下：
巡防师师部机关任命如下：
师长杨孟晗，少将军衔，从二品副将。
后勤部长方浚仑，准将军衔，正五品；兼任军事医学院院长；
镇抚部长袁祖志，准将军衔，正五品；兼陆军军事指挥学院院长
参谋长阿尔贝.皮埃尔，准将军衔；
情报部长何鼎成，上校军衔，正六品；
后勤部副部长龚振麟，上校军衔，正六品；兼任军事工程学院院长。
军事工程学院院长副院长，丁拱辰，中校军衔，正七品。
陆军军事指挥学院常务副院长，克洛德.夏尔，中校军衔；兼任教导营营长。
海军军事指挥学院常务副院长，伍德.肯森，少校军衔。
副官室主任童孟萍，少校军衔，从七品；兼任警卫营营长。
师参谋部副参谋长，赵宇民，军衔中校，正七品。
军事医学院常务副院长，李家沧，少校军衔，从七品；兼任后勤部医务科科长，军事总医院院长。
下属各单位任命如下：
任命陈昱之为第一混编旅旅长，军衔上校，正六品；
任命陈昊之为第二混编旅旅长，军衔上校，正六品；
任命何鼎桂为第三混编旅旅长，军衔上校，正六品；
任命方浚耜为第四混编旅旅长，军衔上校，正六品；
任命蓝新宇为第五混编旅旅长，军衔上校，正六品；
任命武绍荻为第六混编旅旅长，军衔上校，正六品；
任命凌启德为水上纵队纵队长兼本土支队支队长，军衔准将，正五品；兼任海军军事指挥学院院长
任命艾伦.盖尔为师副参谋长、水上支队参谋长，上校军衔；
任命陈旻之为南洋水上支队支队长，军衔中校，正七品；
任命袁祖茂为东海水上支队支队长，军衔中校，正七品；
任命钱芝化为水上纵队陆战团团长，军衔中校，正七品；
任命周立春为大夏独立纵队纵队长，军衔准将，正五品；
任命凌启珙为大夏独立纵队镇抚部部长，军衔上校，正六品；
任命费兰克.鲍尔大夏独立纵队参谋部参谋长，上校军衔；
任命闵路杭为大夏独立纵队后勤部部长，军衔中校，正七品；
任命蓝大盛为大夏独立纵队情报部部长，军衔中校，正七品。
任命常孝候大夏独立纵队第一团团长，军衔中校，正七品；
任命杨孟林大夏独立纵队第二团代理团长，军衔少校，从七品；
任命周秀成大夏独立纵队第三团代理团长，军衔少校，从七品。
任命下达后，各部队进入新一轮编伍和分队战术合成训练；分到各部队的军官和士兵，也陆续开拔，前往驻守地点。
陈昱之的第一混编旅，其中一团驻守定远（含炉桥）、凤阳（含临淮）；另一团驻守淮安、盱眙、桃源（泗阳）、宝应。战略方向是引导流民、疏通粮道，遏制太平军、捻军东进苏北、苏中。
何鼎桂的第三混编旅，一团驻泰州，一团驻高邮，不分散驻扎，随时准备迎击之西、之南来犯之敌。
陈昊之的第二混编旅，以一团驻丹阳，另一团分驻常州、武进、金坛。为江南大营的接应部队，守住大部队的后方。
方浚耜的第四混编旅，一团驻守江阴，一团驻守无锡；当前的作战任务，是配合情报部，围剿太湖流域及长江两岸，流窜的会匪水匪、鸦片贩子。
武绍荻的第六混编旅，分驻苏淞沪太道各地；目前的主要作战任务，也是配合情报部，围剿太湖流域及长江两岸，流窜的会匪水匪、鸦片贩子。
蓝新宇的第五混编旅，作为巡防师的战术机动预备部队，驻虬西大营。
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