鬼童丸为了进一步看破宁次白眼的弱点，便放出更多的苦无及小蜘蛛施以袭击;宁次先后以柔拳·八卦六十四掌及一百二十八掌防御苦无及蜘蛛，但却有一支苦无从他的膊头穿过，使其受伤。鬼童丸立即分析出宁次虽可防御50米半径内的远距离攻击，及有360度视野，但事实上在其背部胸骨第二节有一处盲点，是其白眼所不能观察到的。
鬼童丸即对这个盲点不断施以苦无攻击;及后当宁次以柔拳把下堕的大蜘蛛给打碎后，鬼童丸又乘机放出密集性的苦无攻击，使宁次重伤倒地。
正当鬼童丸以为对方已死时，宁次再度站起来，使鬼童丸决定以咒印状态2打败宁次，并在额头上开出第三眼。鬼童丸从口中以查克拉铸成战弓，并准备以100%准确度的远箭对宁次的盲点施以突袭。
幸而宁次早已在其四周释放了大量的查克拉，使箭的方向稍为偏离于致命点15厘米距离;但始终因为该箭曾是对准其盲点，宁次无法察觉，故最终仍穿其肩而过。鬼童丸又再射一箭，虽再次被宁次躲过，但事前宁次同样是感应不到此箭。
宁次面对实力比自己强的敌人，认为已无法继续避开鬼童丸的攻击，但他想起了鸣人，想起了鸣人那种不屈不挠的精神。决定硬接鬼童丸第三枝远箭（准确度为120%），从箭所连接的查克拉蜘蛛丝注入具攻击性的查克拉，间接性地以柔拳术对鬼童丸的内脏进行破坏。
后更使出新绝招·八门崩击对负伤行动中的鬼童丸施以突击，鬼童丸瞬即重伤倒地。鬼童丸对其不死表示震惊，宁次就指出因为他是被众人所认定、信赖的‘天才’，所以更不能输给任何人，并决心要改变所谓的‘宿命’。宁次认为鸣人既然能把他从黑暗带出来，自然有能力拯救在黑暗中徘徊的佐助。鬼童丸死去后，宁次终于体力耗尽、身负重伤倒在地上。
一片羽毛徐徐飘下，宁次也在宁静中‘休息……后幸得上忍静音及一众医疗忍者的治疗，才从死亡边缘拯救回来。
在日向日足的训练下，学会日向宗家绝技，此时已是上忍。
宁次的样子比第一部更帅，留了一把长发，而且已改穿类似日本和服的衣服，和佐助的装扮极为相似。第三班作为第七班的任务支援而前往砂忍者村，而在进入砂隐村内前就遇上了干柿鬼鲛（实为象转分身），并与其对战。
但宁次三人均被鬼鲛的水牢术困住，只剩凯老师一人孤身作战，同伴天天更感到呼吸困难。后宁次以白眼看破水牢术的薄弱位置，使用柔拳打破水牢、击败水分身，并救了天天。阿凯亦以朝孔雀击败鬼鲛，四人惊讶原来这个鬼鲛只是一个替身。
凯小队（第三班）及旗木卡卡西小队（第七班）一起赶到‘晓’组织集中的地方。该处被一道巨岩石封锁入口，而且入口上及另外四处地方有咒印存在，需要同时撕除这五张咒印方可使岩石打开。阿凯小队便决定分别前往其余四处咒印所在地，留下卡卡西班在岩石的咒印处，一同时撕除这五张咒印。
但就在咒印被撕除之际，其余四处咒印所在地发生了怪异现象。咒印附近出现了跟阿凯小队每一个人一样的分身，而且连忍术也跟他们一样。因此宁次跟另一个自己进行对战。因为分身是以术演变出来，故不会消耗体力；相反，宁次在一轮激战后，体力已消耗很多，所以慢慢跟不上分身的实力，并处于下风。
后因为李洛克的提醒，知道分身只有自己撕开咒印时的力量，所以便使出更强的招式八卦·破山击，把分身击败。宁次等四人后来赶上鸣人和卡卡西等人，并以白眼观察到迪达拉藏匿处。
第四次忍界大战时期，宁次与雏田被分配到第二部队，作为近战联合分队的成员。[12]
宁次经过连番作战，因过度使用白眼加上多处受伤，才刚和犬冢牙离开前线没多久便因为体力不支而昏倒。
牙劝说宁次回到医疗部接受治疗，但宁次仍固执留在战场上，却因为体力处于极度虚弱的状况，开始连牙和赤丸都无法分辨清楚。
与此同时，由于包含宁次在内的许多忍者先前在战斗过程中被白绝分身包覆过身体、吸收部份查克拉的缘故，使得各个战场以及医疗部队中到处充斥着白绝分身伪装的忍者联军成员。其中一只白绝分身变成宁次，混入医疗部中，暗杀许多医疗人员，但最后被樱识破击败。
宇智波带土复活了十尾后，宁次等忍者联军成员来到战场支援鸣人等人。最终，漫画614话/动画584话，宁次为了保护鸣人和雏田，来不及使用回天的他以自己的身体抵挡十尾的扦插之术后壮烈牺牲，额头上终身束缚的分家咒印亦消失。
雏田、小李、天天陷入无限月读中时，曾梦见了宁次安然无恙的画面。
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