天聪十年（明崇祯九年，1636年），萨哈廉让诸贝勒检讨过去，表示今后忠诚效力，皇太极答应可以考虑了。然后皇太极又以“早正尊号”征询汉官儒臣的意见，鲍承先、宁完我、范文程、罗绣锦等都表示赞成。萨哈廉又召集诸贝勒各书誓词，向皇太极效忠。“外藩”诸贝勒闻讯也请求上尊号，皇太极同意了。上尊号的准备活动至天聪十年三月末大体就绪。[39]于崇德元年（明崇祯九年，1636年）五月（1636年5月后改元崇德）称帝，定国号“大清”，改元崇德，改族名女真为满洲。其后将主要兵力用于对明战争。[40]
崇德元年（明崇祯九年，
636年）十一月十九日，皇太极以“朝xian败盟逆命”为由，决定发兵讨伐。十二月二日十时，皇太极率军起行。朝xian国王李倧预料“朝夕被兵”，[41]寄希望于明朝支援，实际落空了。清军于十二月十日渡鸭绿江，十三日抵安州，来势凶猛，史称“丙子虏乱”。第二年正月初七日，清军战胜朝xian全罗、忠清两道援军，李倧逃到南汉山城“势穷情迫”，称臣请罪。皇太极要求严惩朝xian挑起衅端的大臣，同时造船发兵攻入江华岛，获朝xian王妃、王子及阁臣等人。三十日，李倧亲至皇太极面前伏地请罪，史称“丁丑下城”。举行受降仪式后，当即留下其长子及次子为质，其余被俘妻子家口二百余人遣送还京。二月初二日，皇太极自朝xian班师。[42]从此清朝代替明朝把朝xian变成了藩属。朝xian对清朝由以前的兄弟之称，更执藩臣之礼。不久阿济格领兵攻克皮岛，斩明将沈世魁等，彻底解除了清朝攻向关内的后顾之忧。
皇太极对明朝的军事行动仍因山海关的阻隔，分成为入口之战和关外之战。崇德年间一共发动了三次入口之战，每次作战都分出一部分兵力在关外，以为牵制。崇德元年（明崇祯九年，1636年）五月，皇太极派阿济格等领兵出战，这是第一次入口之战。俘人畜十七万九千八百二十，生擒总兵巢丕昌。[43]崇德四年（明崇祯十二年，1639年）三月，清军渡运河，攻破山东济南府，克城败敌，俘人口二十五万余，四月凯旋。清军最大的损失是扬威大将军岳讬死于军中。[44]崇祯帝不但宣布了京师戒严，而且非常忧虑，以致在农民军和清军都攻上来的时候，宁肯暂时放松对农民军的围剿，而把主要力量调到抗清战场上。
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